Die wärmsten Monate sind normalerweise Februar und Januar, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 24 °C. Die kältesten Monate sind November und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von 23 °C. In Zapatoca fällt der meiste Regen im Oktober, November, Mai und April, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 461 mm pro Monat.