Die wärmsten Monate sind normalerweise Januar und Februar, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 25 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 16 °C. In San Javier fällt der meiste Regen im Oktober, Januar, Mai und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 229 mm pro Monat.