Die wärmsten Monate sind normalerweise September und Oktober, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 28 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 26 °C. In Marajá do Sena fällt der meiste Regen im März, Februar, Januar und April, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 277 mm pro Monat.