Die wärmsten Monate sind normalerweise Januar und Februar, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 25 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 15 °C. In Yapeyú fällt der meiste Regen im Oktober, Januar, November und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 183 mm pro Monat.