Das Wetter ist sicherlich ein entscheidender Faktor für Ihren Aufenthalt in Yagishiri Island. So hat jede Jahreszeit ihren eigenen Charme, doch besonders attraktive Schnäppchen locken häufig in den Monaten, in denen das Wetter weniger freundlich ist. Die wärmsten Monate sind normalerweise August und Juli, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 18 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Februar mit einer Durchschnittstemperatur von -1 °C. Den meisten Schneefall sieht Yagishiri Island im Januar, März, Februar und Dezember, mit durchschnittlich 60 cm Schnee pro Monat.