Die wärmsten Monate sind normalerweise August und Juli, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 24 °C. Die kältesten Monate sind Februar und Januar mit einer Durchschnittstemperatur von 5 °C. In Wakura Onsen fällt der meiste Regen im Juli, September, August und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 260 mm pro Monat.