Die wärmsten Monate sind normalerweise April und März, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 25 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von 23 °C. In Sébaco fällt der meiste Regen im Oktober, Mai, September und Juni, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 330 mm pro Monat.