Die wärmsten Monate sind normalerweise Januar und Februar, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 26 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 16 °C. In São Borja fällt der meiste Regen im Oktober, November, Januar und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 201 mm pro Monat.