Die wärmsten Monate sind normalerweise Mai und April, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 28 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von 24 °C. In Santiago Ixcuintepec fällt der meiste Regen im September, Juni, August und Juli, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 187 mm pro Monat.