Die wärmsten Monate sind normalerweise April und Mai, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 24 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von 21 °C. In San José de Bocay fällt der meiste Regen im Juni, Oktober, Juli und Mai, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 274 mm pro Monat.