Die wärmsten Monate sind normalerweise Mai und Juni, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 28 °C. Die kältesten Monate sind Februar und Januar mit einer Durchschnittstemperatur von 27 °C. In Pulau Banggi fällt der meiste Regen im Januar, Dezember, November und Oktober, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 299 mm pro Monat.