Die wärmsten Monate sind normalerweise September und Oktober, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 23 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 21 °C. In Nuevo Progreso fällt der meiste Regen im Februar, Dezember, Januar und März, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 312 mm pro Monat.