Die wärmsten Monate sind normalerweise Juli und August, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 12 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von -12 °C. Den meisten Schneefall sieht Kyzyloy im Februar, März, Dezember und Januar, mit durchschnittlich 42 cm Schnee pro Monat.