Die wärmsten Monate sind normalerweise September und August, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 25 °C. Die kältesten Monate sind Juli und Juni mit einer Durchschnittstemperatur von 24 °C. In Iñapari fällt der meiste Regen im März, Januar, Februar und Dezember, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 317 mm pro Monat.