Die wärmsten Monate sind normalerweise April und Mai, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 28 °C. Die kältesten Monate sind Januar und Dezember mit einer Durchschnittstemperatur von 23 °C. In El Naranjo fällt der meiste Regen im September, Juni, August und Oktober, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 232 mm pro Monat.