Das Wetter ist sicherlich ein entscheidender Faktor für deinen Aufenthalt in Jayapura. Gerade dann, wenn sich das Wetter nicht von seiner besten Seite zeigt, sind die Angebote meist umso attraktiver. Die wärmsten Monate sind normalerweise Oktober und November, dann liegt die Durchschnittstemperatur bei 26 °C. Die kältesten Monate sind August und Juli mit einer Durchschnittstemperatur von 25 °C. In Jayapura fällt der meiste Regen im Dezember, März, April und November, mit einer durchschnittlichen Niederschlagsmenge von 382 mm pro Monat.